Selon, le motif de consultation chaque patient sera pré-orienté vers un praticien spécialisé lors de la prise de rendez-vous (infections par le VIH, hépatites virales, accident d’exposition aux virus, infection sexuellement transmissible, infections osseuses, infections au retour d’un séjour en zone tropicale, morsures de tiques, maladie de Whipple, fièvre Q… ou tout autre type d’infection). Des consultations d’addictologie, de psychothérapie et d’éducation thérapeutique anti-infectieuse sont également proposées aux patients vivant avec le VIH.

Par ailleurs, des consultations d’infectiologie internes destinées aux patients hospitalisés dans les services de l’APHM hors IHU sont assurées quotidiennement sur les sites Timone, Conception, Sainte-Marguerite, Hôpital Nord.

Le diagnostique et le traitement des pathologies infectieuses tropicales parasitaires comme par exemple le paludisme, les parasitoses intestinales, les parasitoses cutanées, les filarioses ; des infections fongiques (les mycoses exotiques) ; des infections virales comme par exemple la dengue, le chikungunya, le zika ou la rage et des infections bactériennes comme par exemple les rickcettsioses, la tuberculose ou la lèpre, constituent l’un des domaines d’expertise de l’Institut Méditerranée Infection.