Notre projet scientifique

Mieux connaître les maladies infectieuses d’aujourd’hui pour anticiper celles de demain

Un modèle d'ouverture

Nous fédérons un ensemble ouvert de compétences scientifiques et médicales pour dimensionner une réponse optimale aux crises sanitaires infectieuses.

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Les chiffres clefs

Publications depuis 2011
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Ville de France en microbiologie
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Centres nationaux de référence
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Axes stratégiques de recherche

Microbiotes et maladies humaines

Le développement diagnostique est un pilier historique de l’IHU. Notre force réside dans la capacité à cultiver et étudier des micro-organismes de tous les domaines du vivant :

  • bactéries, mycobactéries, virus,
  • amibes, levures, archées,
  • micro-organismes émergents (CPR).

Ces travaux ont permis la découverte de plus de 800 nouvelles espèces bactériennes depuis 2011.

Nous avons également développé la culturomique des champignons fastidieux, enrichissant notre compréhension :

  • des dysbioses (malnutrition, vaginose bactérienne…),
  • de pathologies telles que l’entérocolite nécrosante du nouveau-né ou la parodontite.

     

En collaboration avec l’Institut Gustave Roussy, nos recherches ont démontré le rôle clé du microbiote dans l’efficacité des chimio- et immunothérapies, ouvrant des perspectives majeures en oncologie.

Axes stratégiques de recherche

Développement d'outils diagnostiques innovants

Le développement diagnostique est un pilier historique de l’IHU.

Notre force réside dans la capacité à cultiver et étudier des micro-organismes de tous les domaines du vivant :

  • Bactéries, mycobactéries, virus,
  • Amibes, levures, archées,
  • Micro-organismes émergents (CPR).

Nos travaux s’appuient sur :

  • L’optimisation des conditions de culture (milieux, atmosphère, co-culture, température…),
  • La PCR multiplex syndromique,
  • La métagénomique diagnostique, utilisée lorsque les tests standards échouent,
  • La microscopie électronique, pour l’identification directe et l’étude de la sensibilité aux antibiotiques

 

Objectif : réduire l’absence de diagnostic étiologique chez les patients les plus complexes.

Axes stratégiques de recherche

Infections sexuellement transmissibles (IST)

  • La recherche sur les IST est transversale et pluridisciplinaire, menée en France, en Afrique et en Asie.

    Nos axes principaux :

    • Sciences humaines et sociales : recherche communautaire avec les personnes vivant avec le VIH ou les hépatites, évaluation des perceptions et comportements (PrEP en Afrique de l’Ouest).
    • Épidémiologie : surveillance continue des IST en région PACA.
    • Diagnostic moléculaire : PCR multiplex, séquençage et détection des mutations de résistance.
    • Santé des femmes : développement d’outils diagnostiques pour la vaginose bactérienne (VB), démontrant :
      • un lien avec d’autres IST,
      • un impact sur la prématurité,
      • l’efficacité d’une stratégie systématique « dépister et traiter ».

Nos travaux s’appuient sur :

  • L’optimisation des conditions de culture (milieux, atmosphère, co-culture, température…),
  • La PCR multiplex syndromique,
  • La métagénomique diagnostique, utilisée lorsque les tests standards échouent,
  • La microscopie électronique, pour l’identification directe et l’étude de la sensibilité aux antibiotiques

Objectif : réduire l’absence de diagnostic étiologique chez les patients les plus complexes.

Axes stratégiques de recherche

Thérapeutique
et antibiorésistance

L’antibiorésistance est une priorité mondiale et un axe majeur de recherche à l’IHU.

Nos travaux incluent :

  • l’étude des mécanismes et de la circulation des résistances,
  • une approche One Health, incluant des environnements sans pression antibiotique,
  • des découvertes fondamentales sur les bêtalactamases, révélant de nouvelles fonctions enzymatiques.

Nous développons également :

  • de nouvelles thérapeutiques antibactériennes (drug repositioning, nouvelles molécules),
  • des outils innovants d’évaluation de la sensibilité aux antibiotiques (Antilogic, microscopie électronique),
  • des programmes émergents sur les antiviraux et les vaccins, incluant des modèles vaccinaux innovants.

Axes stratégiques de recherche

Infections AU SUD, GRANDS RASSEMBLEMENTS ET VOYAGES

La recherche au Sud est au cœur de la stratégie de l’IHU, fondée sur :

  • la co-construction scientifique,
  • la formation d’étudiants et chercheurs locaux,
  • le transfert de technologies.

Nos actions se déploient en Afrique, en Amérique du Sud et en Asie, avec notamment :

  • le déploiement de laboratoires point-of-care en zones rurales,
  • la surveillance des grands rassemblements (Hajj, Magal de Touba),
  • l’étude des maladies liées aux voyages internationaux.

Nos travaux sur le paludisme et les maladies tropicales négligées (schistosomiase, filarioses) couvrent :

  • la surveillance épidémiologique,
  • le diagnostic,
  • le développement de nouveaux traitements et marqueurs de résistance.