RESPONSABLE
Pr. Pierre-Edouard FOURNIER
pierre-edouard.fournier@univ-amu.fr
L’équipe biobanque est composée de 2 Ingénieurs et 3 techniciens.
Une biobanque est une infrastructure dédiée à la gestion d’échantillons biologiques de haute qualité et de leurs données associées, couvrant l’ensemble du processus, de la collecte jusqu’à leur mise à disposition. Au sein de l’IHU Méditerranée Infection, elle constitue un pilier essentiel de la recherche en mettant à disposition des ressources précieuses pour de nombreux travaux, tels que les études épidémiologiques visant à mieux comprendre les facteurs de risque et la prévalence des maladies, ou encore la recherche génétique, notamment à travers l’analyse des variants viraux. Elle contribue ainsi activement à la conservation des ressources biologiques, à la valorisation des connaissances et à leur exploitation dans le cadre de la recherche fondamentale, appliquée et de l’enseignement.
Depuis le début des années 2000, les échantillons jugés importants ont été conservés quotidiennement dans des congélateurs de laboratoire répartis sur différents sites du campus de la Timone. Cette organisation a permis de constituer progressivement des collections riches et diversifiées. Au fil des années, la biobanque s’est considérablement enrichie, ce qui naturellement conduit à envisager des solutions innovantes afin d’optimiser encore davantage la gestion, l’accessibilité et la performance globale de la biobanque.
Dans cette perspective, l’IHU a engagé une évolution technologique majeure en lançant un projet de robotisation des biobanques, avec l’acquisition de deux automates Azenta (anciennement Brooks). Initié en 2017 et concrétisé après plusieurs années de développement, ce projet ambitieux vise à moderniser les capacités de stockage et à fluidifier l’accès aux échantillons. Les équipements ont été dimensionnés pour accueillir environ 1 million de tubes à -80°C et jusqu’à 2 millions de tubes à -20°C, avec une capacité adaptée aux besoins futurs. Cette transformation marque une étape clé dans l’optimisation des infrastructures et renforce la position de la biobanque comme outil de référence au service de la recherche.
Ces automates répondent à plusieurs points fondamentaux :
Actuellement, une part importante de l’activité de la plateforme biobanque est dédiée au diagnostic. Quelques chiffres des natures les plus courantes :
Depuis l’intégration de la BLAI au sein du CRB APHM , la dynamique de recherche tend à se développer. Le CRB AP-HM est certifié depuis le 8 décembre 2023 selon les normes ISO 9001 et ISO 20387 et est autorisé pour la mise à disposition de ressources biologiques pour des projets de recherche auprès du Ministère de lʼEnseignement supérieur de la Recherche et de lʼInnovation sous le dossier n°2017-2986. Le périmètre de la certification à été étendu depuis octobre 2025 à la BLAI suite au regroupement des deux sites. Cette évolution reflète une volonté claire de développer des collections prédictives à fort intérêt scientifique et de soutenir activement la recherche, notamment grâce à la conservation d’échantillons de haute qualité.
La biobanque concentre 4 activités majeures :
Un Laboratory Information Management System (LIMS) a été conçu sur-mesure par Enovacom afin de faciliter l’enregistrement, le stockage et la sortie des ressources biologiques. Les tubes sont enregistrés sur ce logiciel via un code 2D unique transmis à un second logiciel associé aux automates.
